Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT1P21579 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYT1P21579 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYT1P21579 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms