Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD247P20963 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD247P20963 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD247P20963 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms