Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms