Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPGDP15428 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPGDP15428 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms