Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms