Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms