Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms