Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms