Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms