Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOP08100 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOP08100 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOP08100 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOP08100 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOP08100 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOP08100 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms