Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX4O95219 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX4O95219 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX4O95219 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX4O95219 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX4O95219 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX4O95219 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms