Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms