Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms