Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1O43719 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms