Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DENRO43583 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DENRO43583 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms