Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXA3O43365 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXA3O43365 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXA3O43365 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXA3O43365 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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HOXA3O43365 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXA3O43365 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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