Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3AO14802 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3AO14802 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms