Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN8O00124 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms