Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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