Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms