Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL1A6NKG5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL1A6NKG5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms