Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WASHC2CQ9Y4E1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms