Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms