Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK1Q9UPV9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK1Q9UPV9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms