Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms