Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYH13Q9UKX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYH13Q9UKX3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms