Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms