Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms