Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms