Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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