Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms