Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms