Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms