Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHBDL2Q9NX52 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms