Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms