Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms