Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHST12Q9NRB3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms