Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC3GQ9HC16 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms