Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LNPKQ9C0E8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms