Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHACTR1Q9C0D0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms