Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms