Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEC22CQ9BRL7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms