Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNAQ96QF7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms