Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms