Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms