Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SAMD8Q96LT4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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