Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPD52L3Q96J77 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms