Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms