Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms