Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms